油用牡丹种子长于牡丹果荚中，牡丹果实为蓇葖果，一朵花一般有3～5个牡丹荚，牡丹荚呈五角星形状，其中的每一个角都像一个豌豆荚，荚里面就是榨油用的牡丹籽，一般每个牡丹荚里含有6～14粒大型的黑色有光泽的种子。牡丹籽的采摘绝对是件‘技术活儿’。下面简单介绍下牡丹种子的采收注意事项。
采收油用牡丹果荚的时机选择是非常有讲究的，要恰到好处，否则劳民又伤财。收早了，会因为籽粒成熟度不够而造成育苗率低、出油率低等后果，榨出油的品质也会受影响;收晚了，会因为果荚壳因老化而开裂，造成牡丹籽散落在田里，致使产量降低，更严重的后果是种子不出芽。李博等人曾研究过不同采收时间对“凤丹”牡丹籽生根质量的影响，通过对比不同时间采摘的牡丹籽的生根率及壮苗率，得出结论若牡丹种子早于果荚开裂前20天采收，虽生根率可达90%以上，但不易生壮苗，果荚开裂后采收，则会影响生根率，为提高产量和品质，应于果荚开裂前5-10天采收，则有利于萌生壮苗。
牡丹种子的成熟期因种植地、品种不同而不同，应分批采收。一般而言，在黄河下游，种子成熟采收期为7月下旬(大暑)至8月上旬(立秋)，黄河上游一带为8月中下旬至9月上旬(白露).而在长江流域一带则为7月下旬(大暑前后)。
那么如何判断油用牡丹果荚是否成熟呢?据经验来讲，当油用牡丹果荚的颜色呈蟹黄色时，里面的牡丹籽呈现黑色，则完全成熟了;油用牡丹荚颜色嫩绿，里面的牡丹籽偏白色，这样的牡丹籽采收后即便后期晾晒颜色变黑，但育种时也不会出苗，而且出油率也将大大降低。所以，当大部分牡丹荚呈熟蟹黄色时，即应及时采收。但是，同一块牡丹田里牡丹籽的成熟度也是不一样的，有的牡丹荚呈蟹黄色已成熟，而有的颜色仍然嫩绿，尚未成熟，所以一般一块田要分多次才能摘完全部牡丹荚。另外，采摘过程中最好带着最上面的一片牡丹叶子一起摘下，装袋后稍捂几天，使得牡丹籽充分吸收养分。
牡丹果荚采收后应室内阴干取种，不宜直接剥取，待牡丹果荚充分成熟后牡丹籽便会自然脱落。在阴干过程中需注意采下的油用牡丹荚堆放厚度不宜超过20cm，并要经常翻动，从而促进果皮开裂，爆出种子，而不能开裂的果实可以使用脱粒机脱种。当种子脱出后，继续摊晒至水分11%左右时，即可收藏或运往加工厂加工。
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